塔吉克族群眾過去普遍信仰伊斯蘭教。伊斯蘭教的伊斯瑪儀勒教派在新疆地區只有塔吉克一個民族信仰過。這個教派也流行於印度、阿富汗、巴基斯坦等國家(其中在阿富汗流行最廣，勢力最大。)各地伊斯瑪儀勒教派都有共同的宗教頭領，稱為「忘教主」。這一教派在宗教教義上與其他教派相同，都奉安拉為唯一至高無上的神，信穆罕默德是安拉的使者等等。但是在宗教功課方面有著自己的特點：如在五大天命的「禮」功上，每日不舉行五時拜功，只作早、晚兩時的拜功，並且禮拜時跪著禮拜。主張禮拜的方向可以朝向四面八方。在「齋」功方面，不舉行伊斯蘭教的「來買抓」月(即伊斯蘭教歷九月)的日禁食之齋戒。主張心、眼、嘴、耳、手、腳、忍之七齋。即心要公道，眼不邪視，嘴不搬弄是非，耳不聽讒言惡語，手不拿別人財物，腳不得到熱鬧場所，和忍辱不記仇等七戒。
由於信仰伊斯瑪儀勒派，所以，同其他信伊斯蘭教的民族比較起來，塔吉克的宗教有著他自己的特點。如：宗教活動較少，清真寺也很少。教徒們不封齋，不重朝覲天房聖地。除了部分老人在家作兩次禮拜以外，一般群眾僅在節日舉行禮拜等等。
塔吉克的宗教組織制度也不如維吾爾等族那樣嚴密。宗教的首領「依禪」自稱是「聖人」的後裔，職位世襲。但是他們所管轄教徒的數量和在教派內的威望是各不相同的。
教徒世代信從某一依禪及其繼承者。依禪在教徒比較集中的鄉村，委任當地的一個信徒為「海力派」，作為自己一部分活動的代理人。
由於依禪沒有固定的教區，因此有些鄉村因為教徒分屬幾個依禪而出現一個鄉村有幾個海力派的現象。此外，還有宗教職業者「卡孜」掌握著宗教法律，「阿姆蘭」則是主持節日宗教活動的，他們都在一定地區內進行活動。